ตำบลบ้านโคนแต่เดิมนั้นชื่อบ้านโคลนเหตุที่ชื่อบ้านโคนเพราะว่าหมู่บ้านตั้งอยู่ติดกับแม่น้ำน่านเมื่อยังไม่ได้สร้าง เขื่อนสิริกิตติ์ พอถึงฤดูน้ำหลากน้ำท่วมทำให้ราษฎรในหมู่บ้านสัญจรไปมาไม่สะดวก ชาวบ้านจึงเรียกในทำนอง ประชดว่า บ้านโคลนและได้เรียกติดต่อกันมาเรื่อย ๆ จนได้มาเพี้ยนเป็นบ้านโคนจนปัจจุบันแต่เดิมนั้นตำบลบ้านโคนขึ้นอยู่กับตำบลพญาแมน แยกมาเป็นตำบลบ้านโคนเมื่อปี พ.ศ. 2518